Misi Madrasah Aliyah Yusuf Annur :
- Menyelenggarakan pendidikan berbasis Tahfidz Al-Qur’an yang terintegrasi dengan kurikulum nasional dan internasional
- Meningkatkan kualitas akademik melalui penguatan sains, teknologi, dan digitalisasi madrasah
- Mengembangkan program tahfiz dan program kutub al-turats al-Islami untuk membentuk karakter Qur’ani.
- Menyelenggarakan Ekstrakurikuler yang Relevan untuk menginternalisasi nilai-nilai Al-Qur’an dan Saintek serta bertema global
- Pemberian Apresiasi kepada siswa yang berprestasi di bidang Qur’ani dan Saintek
- Mengembangkan penguasaan bahasa internasional (Bahasa Inggris, Arab dan Mandarin) sebagai bekal komunikasi global.
- Membangun kerja sama dengan lembaga pendidikan dan institusi nasional maupun internasional untuk memperluas wawasan siswa.
- Menerapkan standar ISO.21001:2018 dalam pengelolaan madrasah.
- Pembinaan Karakter Unggul dan bimbingan Kompetisi Qur’an dan Olimpiade Saintek
- Menyiapkan Fasilitas dan Teknologi berbasis digital
- Mengembangkan keterampilan/soft-hard skill serta STEAM (Science, Technology, Engineering, Arts, and Mathematics).
- Memberikan pelatihan dalam teknologi digital, entrepreneurship, dan keterampilan vokasional yang relevan dengan kebutuhan masa depan.
- Mengintegrasikan konsep pendidikan lingkungan dalam kurikulum dan kegiatan madrasah.
- Menerapkan program sekolah hijau (Green School Program) dan Eco pessantren untuk menjaga keberlanjutan lingkungan.